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酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合，从而改变酶的活性，这一过程称为酶的共价修饰或者化学修饰。在共价修饰过程中，酶无活性与有活性两种形式的互变，这两种互变由两种催化不可逆反应的酶所催化，后者又受信号调控的调控。酶的共价修饰包括磷酸化与脱磷酸化、乙酰化与脱乙酰化、甲基化与脱甲基化，腺苷化与脱腺苷化，以及-SH与-S-S-的互变等，以磷酸化修饰最为常见。
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