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1、头部:大鳄的头比较尖,小鳄龟的头比较圆;
2、上颌:大鳄龟上颌似鹰嘴状,钩大,小鳄龟上颌似钩状,但钩小;
3、嘴部:大鳄龟的嘴部比小鳄龟的要长,舌头为红色的结构,口腔底部有一蠕虫样的附器,常静伏水中,张着嘴,借附器诱食附近鱼类,小鳄龟则没有这些特征;
4、背甲:大鳄龟的背甲甲峰很明显,而小鳄龟的甲峰则不明显,近乎平背,背甲看起来比较圆。大鳄龟的背甲上有3条凸起的纵走棱脊,褐色,每块盾片均有突起物,腹甲棕色,具上缘盾,小鳄龟的背甲棕黄色或黑褐色,有3条纵行棱脊,肋盾略隆起。