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二者之间的主要区别是，本义不同、行为表述不同、主语表示不同，具体如下：
一、本义不同
１、坐镇的“镇”为动词，本义为镇守，压镇。
２、坐阵的“阵”为名词，本义为“军阵”，“军队”。
二、行为表述不同
１、坐镇：在表述人专注于某一位置或地方时，“坐镇”指的是“某个有权势、有地位、有影响的人在那里镇守”。
２、坐阵：在指人的行为时，意为“一些人坐于阵中”，它具体表达时有两层意义，一是处于战阵之中并将参加战斗，二是守卫军阵。
三、主语表示不同
１、坐镇：主语只能是指一个人，或是有影响的某个元老，或是有权势的某个主帅，其行为都是镇守。
２、坐阵：主语只能表示多数人，不会是少数人，更不是某一个人。
