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维持蛋白质三级结构的作用力是氨基酸侧链之间的疏水相互作用，氢键，范德华力和静电作用。
蛋白质三级结构是指一条多肽链在二级结构或者超二级结构甚至结构域的基础上，进一步盘绕，折叠，依靠次级键的维系固定所形成的特定空间结构称为蛋白质的三级结构。
蛋白质三级结构的特点为：
含多种二级结构单元；有明显的折叠层次；为紧密的球状或椭球状实体；分子表面有一空穴；疏水侧链埋藏在分子内部，亲水侧链暴露在分子表面。
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