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影响菌种活力的因素有：数量，温度，pH以及培养基营养物的种类及比例。菌种通过自然选育、有性杂交、人工诱变和细胞融合等方法选育出的优良菌株，再经过菌丝无性繁殖应用于生产。从遗传学上看，这样无性繁殖后代，一般都能保持固有的遗传特性。
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