1998年9月15日,新浙江大学宣告成立,即是浙江大学、杭州大学、浙江农业大学和浙江医科大学四所高校合并组建新浙江大学。
20世纪90年代初,我国政府就高等教育提出了“共建、调整、合作、合并”的方针,对高等教育管理体制和结构布局进行调整。在这个情况下,任浙江农业大学校长的朱祖祥院士和浙江大学副校长王启东教授,在1996年的全国人大会议上提出将原来分开的4所大学重新合并组建新的浙江大学的提议,得到了中央领导、教育部和浙江省政府的支持。但四校合并涉及到很多的利益调整。
9月15日,新浙江大学正式成立。仅用半年,原有四校的行政机构调整整合完毕。一年内,学科调整完毕。在这段时间,有相当数量的大学实行了合并,社会争议很多,但是对于浙江四校的合并,社会各界普遍认为是成功的。
新浙江大学合并两年后,学校的事业就有较大发展,教育部曾以“新浙大成立两年,各项事业取得新进展”为题发文件加以肯定。