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常染色质与异染色质的区别在于:两者结构上连续,化学性质上没有差异,只是核酸螺旋化程度(密度)不同。核酸是一类生物聚合物,是所有已知生命形式必不可少的组成物质。核酸是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的总称。
常染色质是染色质(由DNA、RNA和蛋白质组成)的一种松散聚集的形式,这种聚集方式在基因中大量存在,并且相应的片段通常处于活跃的转录当中(但并非必要,即常染色质部分不一定都是高表达的序列)。常染色质构成了细胞核基因组中表达最活跃的一部分。