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裸斑鱼用鳃呼吸的,当水流经过鱼鳃的时候,鳃丝内的微血管可以获取水中的氧气,同时还能排出二氧化碳。除了鱼鳃外,还有一些鱼类具有其它的辅助呼吸器官,比如非洲的肺鱼可以用它们的鱼鳔呼吸,而泥鳅在水中氧气含量不足的时候,会游到水面将气体吞入肠道呼吸,弹涂鱼还能用皮肤呼吸。