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生物化学中的pi代表磷酸基团。磷酸基团一般是出现在生物中的，一般是指磷酸酰基，即磷酸脱去一个羟基的结构，也可以是脱去两个羟基的磷酸基团，这类结构在很多细胞活性物质都有，比如ATP、核苷酸等。磷酸基团不同于磷酸，磷酸指无机物磷酸，在生物中是指游离磷酸。
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