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微生物包括:
细菌:革兰氏阴性的如铜绿假单胞菌,大肠杆菌,沙门氏菌等,革兰氏阳性如金黄色葡萄球菌,链球菌、梭状芽孢杆菌等。
放线菌:如链霉菌属。
真菌:真菌分为霉菌、酵母菌、蕈菌,霉菌有黑曲霉、毛霉、青霉、根霉等,酵母菌有酿酒酵母,白色念珠菌,假丝酵母。
蕈菌是大型子实体真菌,蘑菇。