结局中,陆文昭被官兵围剿而亡,沈炼等人均存活。《绣春刀2》的时间线发生在《绣春刀1》之前,也就是说结局的时候,沈炼最终在犯人名单中赦免了沈炼,并且令他回归锦衣卫工作,设立为总旗,都是承接了《绣春刀》的故事,而《绣春刀》就是发生在第二部的后几年,魏忠贤被贬,并且在逃离的途中被赵靖忠刺杀身亡。
结局中,沈炼在与官兵的对抗过程中,陆文昭最终得知了自己也是信王手下的一枚政治棋子,失去作用后还是会被抛弃,最终陆文昭战死,沈炼拼死对抗,却一拳难敌四手,被关押至监狱内。
另外一边,信王成功继位,年号改为宗祯,之前对魏忠贤毕恭毕敬的信王,转眼间换了另外一个态度,并且要求魏忠贤退出政坛,同时赦免了沈炼等人,沈炼被降职为总旗回归锦衣卫,魏忠贤被革职,而北斋独自一人回到了杭州。
之后的故事就承接了《绣春刀》,沈炼与卢剑星、靳一川结义,魏忠贤成为通缉犯,最终被赵靖忠刺杀。