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机身颜色不同：黑鲨3的机身颜色有闪电黑、铠甲灰、星辰银、璀璨粉4种配色可选。黑鲨3s的机身颜色有天云黑、水晶蓝。
ROM存储类型不同：黑鲨3ROM存储类型是UFS 3.0，黑鲨3sROM存储类型是UFS 3.1。
电池容量不同：黑鲨3电池容量为4720mAh，搭载465W快充。黑鲨3s采用了串充并放充电方案，并搭配了一块4720mAh大容量双电池，可以有效增加电池续航时长，等效增加电池容量约300mAh。
售价不同：黑鲨3的8GB + 128GB版本售价3499元，12GB+256G版本3999元，12GB+128GB版本3799元。黑鲨3s的12GB+128G版本售价3999元，12GB+256G版本4299元，12GB+512GB版本4799元。
