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微生物发酵需要五个条件：菌种、空气、水分、适宜的温度和营养。
同其他发酵方法相比，它具有很多特点：
1、液体悬浮状态是很多微生物的最适生长环境。
2、在液体中，菌体及营养物、产物易于扩散，使发酵可在均质或拟均质条件下进行，便于控制，易于扩大生产规模。
3、液体输送方便，易于机械化操作。
4、厂房面积小，生产效率高，易进行自动化控制，产品质量稳定。
5、产品易于提取、精制等。因而液体深层发酵在发酵工业中被广泛应用。
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