第一部结局:最后太一他们几个人回到原来的现实世界,数码宝贝们留在数码世界,孩子们与他们的数码宝贝分开。
第二部结局:变种吸血魔兽被打败,及川悠纪夫有了自己的数码宝贝,但是他看到数码世界被破坏,就牺牲自己,使数码世界复原了,被植入黑暗种子的孩子们也找回了梦想,并得到了他们的数码宝贝。然后是二十年后的事情, 数码宝贝被世界所认可,每个人都有自己的数码宝贝伙伴。太一成了企业家;阿和成了宇航员;大辅开了拉面馆;小贤和小京结婚了,有三个小孩;嘉儿当了幼儿园老师;阿武成了小说家;伊织成了律师。
第三部结局:树莉把数码器指向帝厉魔的墙壁,数码器便射出耀眼的光芒。此时,红莲骑士兽正在和帝厉魔展开壮绝的生死决战。尽管把它们一只只地打倒,但仍无法靠近树莉所在的地方,但这个时候,一团赤黑的黏液流进室内,液体填满了树莉所在的球体,夺去了她逃走的地方。
第四部结局:拓也他们合体为金刚武神兽,打败了六翅兽,再后来他们与斗士精神告别,回到了现实世界。