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对未成熟的植物种子的保护作用,对动物的口腔产生强刺激,使它不敢采食。辣椒成熟后它的辣椒素的含量会降的很低甚至几乎没有。
例如:普通的大辣椒,成熟后,变成红色,将内部的种子和胎座去掉后,可以发现辣椒的果肉是甜的。
辣椒素是辣椒的活性成分。它对哺乳动物包括人类都有刺激性并可在口腔中产生灼烧感。辣椒素和与其相关一些的化合物并称为辣椒元,它们是辣椒产生的次级代谢产物,可能为了对草食动物形成威慑。一般鸟类都不对辣椒元敏感。纯辣椒素是一种斥水亲脂、无色无嗅的结晶或蜡状化合物。