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丢失了农村宅基地证，可以去房屋管理部门申请补办。
补办流程如下：
1、先登报声明将原《房屋所有权证》作废，登报后张贴公告征求异议；
2、10日后如无异议由房主申请所属镇的规划建设管理站的工作人员到实地测量；
3、房屋所有权人提供身份证、户口薄复印件、登记声明作废报纸原件、村委证明等相关材料；
4、申请重新办理《房屋所有权证》。
农村房产证补偿的费用分为三个部分：
1、申请遗失登记不收费；
2、补办房产证交纳房屋所有权证工本费10元每本，档案费10元每份；
3、登报费用，登报费用具体需要咨询报社。
