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蓝菠萝鱼可以从以下5方面区别公母：
1、看泄殖腔：在臀鳍后，泄殖腔凹进去的是雌性，泄殖腔凸出来的是雄性；
2、摸鱼鳃盖骨：鳃盖骨有粗糙感觉是雄性，即所谓生殖季节有珠星；
3、看尾鳍或臀鳍：有很长鳍的是雄性，没有的是雌性；
4、看个体：个体较小的为雄性，个体较大的是雌性；
5、看肚子：在生殖季节肚子较扁的是雄性，较鼓的是雌性。
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