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股权确认纠纷证据有：
1、股东名册
以公司股东名册的记载来确认股东的资格，得到了世界范围内公司法律的广泛认可。各国法律普遍认为，股东名册具有当然授予股东资格的法律效力。
2、公司章程
章程是公司作为社团法人最为主要的象征之一，被称为公司的“宪法”。
3、出资证明书
我国公司法规定，有限公司成立后应当向股东签发出资证明书。出资证明书应当包含股东的姓名或者名称、缴纳的出资额和出资日期等内容。
【法律依据】
《公司法》第七十一条：有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
